Genómica de rotavirus. Impacto en salud pública / Rotavirus genomics. Public health impact

Resumen: Con la introducción de las vacunas de rotavirus Rotarix (RV1) o RotaTeq (RV5) en programas nacionales de vacunación de diversos países, surgió la preocupación de que la presión inmune generada condujera al aumento en la prevalencia de genotipos virales no incluidos en las vacunas, o bien del surgimiento de nuevas cepas que pudieran escapar a la respuesta inmune protectora inducida por la vacunación. La variación natural de los rotavirus ha hecho que sea muy difícil distinguir si el cambio en las cepas circulantes se debe a la presión selectiva impuesta por las vacunas o bien a la fluctuación natural de las cepas. Si acaso ha habido una presión selectiva, ésta ha sido hasta ahora baja. Sin embargo, es importante mantener la vigilancia epidemiólogica y poner atención al surgimiento de cepas resistentes a la inmunidad, en particular en países en desarrollo en los que se ha descrito una mayor diversidad viral.

Abstract: With the introduction of rotavirus vaccines Rotarix (RV1) or RotaTeq (RV5) in the immunization programs of an increasing number of countries, there is concern that the immune selection pressure induced will cause an increase in the prevalence of virus genotypes not included in the vaccine formulation, or to the appearance of novel rotavirus strains that could evade the protective immune response. The natural fluctuation of rotaviruses makes it difficult to distinguish if the change in the circulating strains is due to the vaccine selective pressure or to the natural diversity fluctuation of viruses. If there has been a selective pressure, it has been low so far. However, it is important to keep an epidemiological surveillance and pay attention to the emergence of strains that are resistant to the vaccine, in particular in those countries where the viral diversity has been shown to be higher.

Assessment of Epstein-Barr virus nucleic acids in gastric but not in breast cancer by next-generation sequencing of pooled Mexican samples

Gastric (GC) and breast (BrC) cancer are two of the most common and deadly tumours. Different lines of evidence suggest a possible causative role of viral infections for both GC and BrC. Wide genome sequencing (WGS) technologies allow searching for viral agents in tissues of patients with cancer. These technologies have already contributed to establish virus-cancer associations as well as to discovery new tumour viruses. The objective of this study was to document possible associations of viral infection with GC and BrC in Mexican patients. In order to gain idea about cost effective conditions of experimental sequencing, we first carried out an in silico simulation of WGS. The next-generation-platform IlluminaGallx was then used to sequence GC and BrC tumour samples. While we did not find viral sequences in tissues from BrC patients, multiple reads matching Epstein-Barr virus (EBV) sequences were found in GC tissues. An end-point polymerase chain reaction confirmed an enrichment of EBV sequences in one of the GC samples sequenced, validating the next-generation sequencing-bioinformatics pipeline.

Pronóstico de la diarrea por rotavirus / Prognosis of rotavirus diarrhea

Objetivo. Comparar la gravedad de la diarrea por rotavirus (RV) y por no rotavirus. Material y métodos. Estudio transversal en 520 lactantes con diarrea aguda, efectuado entre octubre de 1994 y marzo de 1995 en siete centros del primer nivel de atención en cinco estados de México. El diagnóstico de RV se realizó con ensayo inmunoenzimático o por electroforesis. El análisis se hizo a través de medidas de tendencia central. Los resultados se presentan como promedio y desviación estándar o mediana o variación. Resultados. Se aisló RV en 264 lactantes (50.7 por ciento) con predominio en varones de 6 meses a un año. Las manifestaciones clínicas fueron significativamente diferentes entre el grupo rotavirus positivo y el grupo rotavirus negativo en mediana de evacuaciones por 24 horas, frecuencia de vómitos, temperatura > 38º C, deshidratación y calificación de gravedad, respectivamente. Conclusiones. Estos resultados mostraron peor pronóstico por mayor gravedad de la diarrea por RV en lactantes, con relación a otra etiología. El texto completo en inglés de este artículo está disponible en: http://www.insp.mx/salud/index.html

Determinación de serotipos VP4 y VP7 de rotavirus de humano mediante el uso de anticuerpos monoclonales / Serotypes VP4 and VP7 of human rotaviruses are determined using monoclonal antibodies

Introducción. Como parte de estudios tendientes a determinar la utilidad de anticuerpos monoclonales para distinguir serotipos de VP4 de rotavirus humanos (RVH), se determinaron los serotipos de P1A y P2 en cepas de campo de RVH, a través de un ensayo inmunoenzimático. Material y Métodos. Se colectaron de Enero a Febrero de 1994, 13 muestras de heces de niños con diarrea aguda, atendidas en la ciudad de Mérida, Yucatán, México, en las cuales se diagnosticó la presencia de rotavirus por electroforesis de RNA viral en geles de poliacrilamida y por un ensayo inmuno-enzimático. Además del serotipo de VP4, a las 13 muestras positivas a rotavirus se les determinó el serotipo de VP7 (G1 a G4) y subgrupo de VP6 (I y II). Resultados. Doce de las 13 cepas estudiadas (92.3 por ciento) fueron serotipo P1A, ninguna P2, y en 2 (7.7 por ciento) no fue posible determinar el serotipo G1 y 4 (30.77 por ciento) serotipo G3, mientra que 12 cepas (92.3 por ciento) fueron subgrupo II, y en una (7.7 por ciento) no fue posible determinar el subgrupo. Discusión. Estos resultados demuestran una alta prevalencia del serotipo P1A, y la cocirculación de los serotipos G1 y G3 del subgrupo II de rotavirus en niños con diarrea aguda en la zona geográfica estudiada

Taller de epidemiología molecuar sobre enfermedades virales / Molecular epidemiology workshop on viral diseases

Con el propósito de promover la interacción entre investigadores en epidemiología y virología se realizó un taller sobre epidemiología molecular de virus en la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México el 29 de septiembre de 1995. En este taller, en el que participaron 18 ponentes de 10 instituciones diferentes, los investigadores presentaron sus trabajos y experiencias en esta área. Durante el taller se hizo un análisis somero de la frecuencia y distribución de las enfermedades virales de importancia epidemiológica y se presentaron trabajos sobre: rotavirus, poliovirus, virus sincitial respiratorio, virus del dengue, papilomavirus, VIH virus de la rabia y virus de las hepatitis